Рафальський пішов із посади заступника глави Адміністрації Президента через люстрацію

Рафальський вирішив піти за власним бажанням. Заяву він подав до набрання чинності Закону України «Про очищення влади».
Працювати в АПУ Рафальський почав на початку 2000-х. У 2003 році він очолював головне управління з питань внутрішньої політики АПУ Леоніда Кучми.
З 2006 по 2007 роки працював на посаді заступника керівника апарату прем'єр-міністра Януковича.
У 2008 році став співробітником апарату Верховної ради, а в березні 2010-го указом президента Януковича його призначено заступником глави АПУ – керівником головного управління документального забезпечення.
У квітні 2011 року у результаті адмінреформи Рафальського позбавили посади в управлінні, однак він залишився одним із трьох заступників глави АПУ.
Взимку 2014 року, після втечі Януковича, указом в.о. президента Олександра Турчинова Рафальський призначений в.о. глави Адміністрації Президента. Згодом його перевели у заступники.
10 червня 2014 року президент Петро Порошенко своїм указом закріпив за Рафальским посаду заступника голови АПУ.